Действие «Tokyo Ghoul:re» происходит спустя некоторое время после устроенной CCG карательной операции.

История разворачивается вокруг одного молодого следователя CCG, Сасаки Хайсэ. Сасаки – следователь по гулям первого класса и наставник Отряда Куинксов – группы новичков, которой поручена конечная цель CCG: полное уничтожение естественного врага человечества, известного как «гули». Так получилось, что он помнит лишь последние три года своей жизни, и каждую ночь во снах ему является парень с "белыми" волосами. "Кто он? Что он хочет от меня? Почему я вижу его в своих снах?" - у Сасаки много вопросов, на которые он хочет найти ответы, и, возможно, скоро их найдет...